Functional diversity of sessile and planktonic microbial communities in a simulated aquifer system [Quebec, Canada, 2023]

The physicochemical metadata correspond to the environmental data used in my analyses. For additional details about the methodology and results, please refer to my thesis (link provided below). [Français] Des données ont été recueillies dans un seul système aquifère durant deux saisons différentes (été et hiver) à Covey Hill, au Québec, Canada, en 2023.

Des échantillons d'eau souterraine ont été pompés dans un bioréacteur afin de reproduire les conditions saisonnières naturelles. Certains paramètres physico-chimiques ont été mesurés directement dans l'aquifère, tandis que d'autres ont été obtenus à partir d'échantillons prélevés lors des incubations dans le bioréacteur. J'ai inclus les métadonnées physico-chimiques et les fichiers FASTA (séquences FAA) utilisés dans le cadre de mon projet de maîtrise.

Les fichiers FASTA contiennent les séquences d'acides aminés obtenues par l'assemblage de contigs de 1 kb. Ces séquences ont servi à l'annotation fonctionnelle à l'aide de BlastKOALA. Les métadonnées physico-chimiques correspondent aux données environnementales utilisées dans mes analyses.

Pour plus de détails sur la méthodologie et les résultats, veuillez consulter ma thèse (lien ci-dessous).