Data · dataset · 2026
Datasets related to microbiota-dependent regulation of mouse colonic epithelial cells
Listed in REDU - Unicamp Institutional Research Data Repository
Este conjunto de dados compreende dados de transcriptômica de célula única de células epiteliais colônicas de camundongos, dados de sequenciamento do gene 16S rRNA para caracterização da microbiota intestinal e quantificações histológicas de contagem celular.
Description
O propósito do dataset é investigar a regulação dependente da microbiota sobre a identidade, composição e respostas funcionais do epitélio intestinal em diferentes condições experimentais, incluindo camundongos tratados com antibióticos, specific pathogen free e germ-free.
O conjunto inclui matrizes de contagem gene × célula processadas, tabelas de abundância taxonômica da microbiota, quantificações histológicas e metadados experimentais associados que sustentam as análises apresentadas na tese e na publicação correspondente. Os dados de sequenciamento gerados neste estudo encontram-se depositados no NCBI, BioProject PRJNA1136851 (16S amplicon sequencing) e BioProject PRJNA1136828 (single-cell gene expression profiling).
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Os dados suplementares associados estão disponíveis no DOI: doi.org/10.1080/19490976.2025.2573045
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- Dataverse dataset page redu.unicamp.br/dataset.xhtml?persistentId=doi%3A10.25824%2Fredu%2F3JAARS ↗
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- DOI doi.org/10.25824/redu/3jaars ↗
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Topics
- Stated by source
- Medicine, Health and Life Sciences
- From keywords
- Gene expression · Life Sciences · Medicine & Health
- Inferred from text
- Sequencing 75%
Provenance · 1 source records, 11 field assertions
| Source | Key | Last seen | Raw |
|---|---|---|---|
| REDU - Unicamp Institutional Research Data Repository | doi:10.25824/redu/3JAARS | 12 d ago | JSON v1 |
| Field | Assertion | Extractor | Evidence |
|---|---|---|---|
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